Para preparar o tomilho fresco para o uso, remova as folhas dos talos passando as mãos de cima para baixo e depois picar finamente. Seu aroma aparece quando as folhas são amassadas, picadas ou esfregadas entre os dedos. Sendo o tomilho um dos principais componentes do bouquet garni clássico, ele dá vida às sopas, molhos e guisados.
Também é muito utilizado quando seco no preparo das ervas de Provença, além de combinar muito bem com carnes, vegetais e molhos para salada.